Diferencias entre los resultados de espectrometría de masas de muestras de encéfalo al someterlas a diferentes métodos de preparación
Author/s: Rojas Cruz, Lino Arturo
Advisor/s: Moral Dardé, Verónica
Keyword/s: Espectrometría de masas; Cromatografía de gases y espectrometría de masas; Cerebro; Lenguajes de programación; “R”; Software de fuente abierta
Date of defense: 2022-11
Type of content:
TFM
Abstract:
El estudio de la neuroproteómica es uno de los campos que más ha avanzado en los últimos
años, el estudio de las particularidades del cerebro, su composición y estructura, son de especial
relevancia en la actualidad por su complejidad y su relación con el resto de los sistemas de cuerpo.
Así, la espectrometría de masas es una herramienta potente que brinda gran información
cuantitativa sobre el mismo. La hipótesis planteada ha sido que, los resultados de la
espectrometría de masas de muestras de cerebro, que tengan protocolos de preparación diferentes,
presentarán resultados diversos sin alterar la estructura básica de los parámetros de interés. El
objetivo principal del estudio es analizar los datos de espectrometría de masas de las muestras de
cada individuo usando un laboratorio virtual, creado con herramientas de fuente libre. Se ha usado
como materiales, datos de muestras de 3 réplicas biológicas de cerebro, con 4 protocolos
diferentes de preparación de muestra, analizadas mediante espectrometría de masas, realizando
un total de 12 experimentos, obteniendo un total de 144 análisis diferentes como resultado. La
metodología del análisis de cada experimento se creo en lenguaje de programación R, usando
varias librerías de fuente abierta para analizar datos masivos, espectrometría de masas y datos
bioestadísticos. Dentro de los resultados cabe señalar que, se ha encontrado patrones comunes
entre muestras en los diferentes experimentos, pero a pesar de ello, se han presentado resultados
aberrantes en varios resultados, rompiendo los patrones comunes, sin embargo, no se ha logrado
encontrar un factor común que sea el causante de esta perturbación en los resultados. Se ha llegado
a la conclusión de que se tiene que estudiar el tema con mayor profundidad, existe poca
información con este enfoque en investigaciones sobre tejido de cerebro, sobre todo porque se
conoce que las células cerebrales no se comportan de la misma en comparación con las demás.
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